Introdução: Os erros inatos do metabolismo (EIM) geram doenças metabólicas hereditárias e são definidas como a falta de atividade de uma ou mais enzimas específicas ou defeitos no transporte de proteínas. Mais de 300 doenças geradas por EIM são conhecidas atualmente, número que aumenta progressivamente, na medida em que novas técnicas de investigação estão sendo desenvolvidas. Eles não são raros, de acordo com a incidência cumulativa, que é de cerca de um caso entre 5000 nascimentos, sendo que a incidência de cada doença metabólica é bastante variável, principalmente de acordo com a etnia. Objetivos: Identificar o papel do Programa de Extensão Farmácia Universitária (FU) no tratamento de EIM a partir do produto de discussão com a equipe multiprofissional que acompanha esses pacientes. Procedimentos Metodológicos: No período de 09 a 10 de outubro de 2014 a FU da Faculdade de Farmácia da Universidade do Brasil (UFRJ), organizou seu 1º Workshop cujo tema foi “Contribuição das Farmácias Magistrais no Tratamento de EIM”. Contando com a participação de cerca de 90 pessoas entre palestrantes, farmacêuticos e outros profissionais de saúde além de alunos de cursos de Farmácia e de outros cursos da área de saúde foi possível: Conhecer o diagnóstico, a clinica e a terapêutica dos EIM para possibilitar o desenvolvimento de formulações magistrais personalizadas para este público alvo e conhecer os principais problemas enfrentados por esse grupo, bem como as alternativas de resolução, com a apresentação de algumas experiências. Principais Resultados: Como produtos do encontro destacaram-se a necessidade de criação de uma rede de instituições e profissionais que trabalhem com EIM para discutir os problemas inerentes ao grupo; o desenvolvimento de formulações magistrais que atendam às necessidades dos portadores dessas patologias; o acompanhamento do uso de medicamentos por esses pacientes além da elaboração de material educativo. Algumas formulações necessárias ao tratamento desses pacientes, acordadas no evento, já fazem parte dos medicamentos manipulados na FU como Benzoato de Sódio, Bicarbonato de sódio, Biotina, Piridoxina, Tiamina e outras contendo L-carnitina, Coenzima Q10 e Glicina estão sendo analisadas para compor o elenco de medicamentos disponibilizados. Atualmente a FU acompanha o tratamento farmacoterapêutico de 05 pacientes com algum tipo de EIM, mas pretende com a divulgação por meio de eventos como esse, ampliar suas ações de atenção farmacêutica em EIM. Conclusões: As farmácias magistrais têm um papel fundamental na preparação e no acompanhamento de uso desses medicamentos personalizados face a diversidade de tratamentos dos pacientes com EIM.